Seq2FunM report at 2022-07-12 12:19:00

Functional quantification results: (click to show/hide)

Id	sample	class	n. S2F ids	S2F ids rate(%)	n. S2F ids(db)	n. reads (S2F id)	S2F id reads rate(%)	n. clean reads	clean reads rate(%)	n. raw reads	n. core orthologs	core orthologs rate(%)	n. core orthologs (db)	time used	date
1	A1.CE2-S1	control	12643	56.449524	22397	2315257	46.305140	4992346	99.846920	5000000	10187	86.616783	11761	0 hours 3 minutes 1 seconds	Tue Jul 12 11:36:04 2022
2	A3.CE1-M2	middle	13146	58.695361	22397	2231719	44.634380	4992651	99.853020	5000000	10520	89.448174	11761	0 hours 2 minutes 54 seconds	Tue Jul 12 11:39:05 2022
3	A4.CE1-H5	high	13400	59.829441	22397	2233583	44.671660	4993129	99.862580	5000000	10717	91.123207	11761	0 hours 2 minutes 59 seconds	Tue Jul 12 11:41:59 2022
4	B1.CE2-S2	control	13877	61.959191	22397	1934896	38.697920	4990746	99.814920	5000000	10999	93.520958	11761	0 hours 2 minutes 54 seconds	Tue Jul 12 11:44:58 2022
5	B3.CE1-M3	middle	13074	58.373889	22397	2203562	44.071240	4989164	99.783280	5000000	10477	89.082558	11761	0 hours 2 minutes 52 seconds	Tue Jul 12 11:47:52 2022
6	C1.CE2-S3	control	12645	56.458454	22397	2318308	46.366160	4992263	99.845260	5000000	10186	86.608284	11761	0 hours 2 minutes 57 seconds	Tue Jul 12 11:50:44 2022
7	C3.CE1-M4	middle	13266	59.231147	22397	2207383	44.147660	4992906	99.858120	5000000	10594	90.077377	11761	0 hours 2 minutes 53 seconds	Tue Jul 12 11:53:41 2022
8	D1.CE2-S4	control	13360	59.650846	22397	2242757	44.855140	4992446	99.848920	5000000	10696	90.944649	11761	0 hours 2 minutes 40 seconds	Tue Jul 12 11:56:34 2022
9	D3.CE1-M5	middle	13703	61.182301	22397	2151363	43.027260	4989985	99.799700	5000000	10911	92.772720	11761	0 hours 2 minutes 58 seconds	Tue Jul 12 11:59:14 2022
10	E1.CE2-S5	control	12850	57.373755	22397	2209094	44.181880	4992482	99.849640	5000000	10326	87.798660	11761	0 hours 3 minutes 2 seconds	Tue Jul 12 12:02:13 2022
11	E3.CE1-H1	high	13076	58.382819	22397	2202064	44.041280	4993097	99.861940	5000000	10444	88.801971	11761	0 hours 2 minutes 47 seconds	Tue Jul 12 12:05:15 2022
12	F3.CE1-H2	high	13576	60.615261	22397	2212158	44.243160	4992901	99.858020	5000000	10802	91.845932	11761	0 hours 2 minutes 48 seconds	Tue Jul 12 12:08:02 2022
13	G3.CE1-H3	high	13594	60.695629	22397	2152325	43.046500	4992496	99.849920	5000000	10830	92.084007	11761	0 hours 2 minutes 45 seconds	Tue Jul 12 12:10:50 2022
14	H2.CE1-M1	middle	12946	57.802384	22397	2340819	46.816380	4987281	99.745620	5000000	10429	88.674431	11761	0 hours 2 minutes 43 seconds	Tue Jul 12 12:13:35 2022
15	H3.CE1-H4	high	13140	58.668572	22397	2283325	45.666500	4989941	99.798820	5000000	10517	89.422668	11761	0 hours 2 minutes 41 seconds	Tue Jul 12 12:16:18 2022

Rarefaction curve (S2F id) (click to show/hide)

Rarefaction curve (S2F) 3D (click to show/hide)

Top abundant S2F ids (click to show/hide)

S2F id Table (full list) (click to show/hide)

Sample	A1.CE2-S1	A3.CE1-M2	A4.CE1-H5	B1.CE2-S2	B3.CE1-M3	C1.CE2-S3	C3.CE1-M4	D1.CE2-S4	D3.CE1-M5	E1.CE2-S5	E3.CE1-H1	F3.CE1-H2	G3.CE1-H3	H2.CE1-M1	H3.CE1-H4	KO	GO	Symbol	Name	Ortholog Freq
Class	control	middle	high	control	middle	control	middle	control	middle	control	high	high	high	middle	high	-	-	-	-	-
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